O INI, em conformidade com as Portarias nº 491/2021 e 549/2022 da Presidência da Fiocruz, adota diretrizes para ações afirmativas em seus programas e cursos, visando à equidade e à redução de desigualdades relacionadas à raça, à deficiência e a outros marcadores sociais. Essa política é desenvolvida de forma transversal, com a participação das coordenações de cursos, das comissões de heteroidentificação e biopsicossocial, e com o suporte do Núcleo de Apoio ao Estudante, para viabilizar o ingresso e a permanência de estudantes na pós-graduação.